Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep350E9Q309 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep350E9Q309 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms