Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5cE9Q1F5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5cE9Q1F5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms