Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms