Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms