Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc1E9Q043 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms