Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms