Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms