Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp4E9PYK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms