Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sfta2E9PXB6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms