Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms