Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gimd1E9PW74 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gimd1E9PW74 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gimd1E9PW74 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gimd1E9PW74 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gimd1E9PW74 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gimd1E9PW74 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gimd1E9PW74 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms