Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms