Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms