Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms