Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3676D3Z236 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms