Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms