Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms