Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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