Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms