Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.5 ms