Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam47eD3YWC7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam47eD3YWC7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms