Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms