Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms