Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc5C3VPR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms