Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms