Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd8B9EJ80 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms