Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5483B2RV77 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms