Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms