Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apol7aB2RT54 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms