Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfc3h1B2RT41 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfc3h1B2RT41 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms