Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
JrklB2RRL2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms