Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms