Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms