Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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