Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms