Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms