Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms