Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms