Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms