Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms