Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr16A3KMN5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr16A3KMN5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Prr16A3KMN5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr16A3KMN5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Prr16A3KMN5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Prr16A3KMN5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Prr16A3KMN5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr16A3KMN5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Prr16A3KMN5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Prr16A3KMN5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Prr16A3KMN5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr16A3KMN5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms