Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf39A2RT81 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms