Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Patl2A2ARM1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms