Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll9A2APC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms