Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3fA2ANE1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms