Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Shroom2A2ALU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shroom2A2ALU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms