Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FocadA2AKG8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms