Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3aA2AIR5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms