Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ambra1A2AH22 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms