Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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